我的大学

本文记录了一点自己对于大学的感受以及对于专业、生活方式和自己的思考。分享出来其实蛮需要勇气的，相当于把自己四年的全部公之于众，但是还是希望这些文字对他人能有些许帮助，不希望后来人再走相同的弯路。

回顾

专业

本科因为采集、会议等走过了山东11个地级市、辽宁2个地级市、吉林3个地级市、黑龙江2个地级市、江苏1个地级市以及3个直辖市。在外约4.5个月（主要是大一下学期，到大三上学期），暑假往往不在家里待，曾因为学校宿舍的炎热（大致晚上都会30+度），当学校作为采集中转站的时候，我住过金拱门豪华大酒店和实验室（今年夏天生科院的同学们因为要搬宿舍大致还是没有空调）。

一共参加了2次学术会议。1次英文，1次中文，也就有2篇会议论文。

一共担任了2次审稿人。1次SCI的，1次非SCI的。

一共发了5篇论文。2篇非SCI，2篇SCI四区，1篇SCI二区Top。一共被拒稿无数（∞）次。

一共加入了2个专业方面的学会。1个是学生会员，国内的；1个是国外会员，自然是国外的。

虚荣

一共获得过2次奖学金。1次2等，1次1等（顺带吐槽一下，学校给的真少）。

阴差阳错参加了1个研究生论坛，获得了2等奖，还认识了很让我佩服的教授（就是那种自己想要成为的样子，那几天特别开心）。

参与了学校的科研训练项目。主持了1项国家级大学生创新创业项目，拿到了优秀（并且同批次答辩最高分）的结项的成绩（答辩现场diss了某位导员，很解气）。

参加了全国大学生生物竞赛的山东省赛区比赛，第一个讲，没把ppt讲完（虽然评委的提问到了脱离科学的离谱），获得了省级2等奖；帮实验室团队成员想了个点子，她很开心地拿到了国家级3等奖（我也很开心）。

创青春获得了校级铜奖，还有个大一被拉进的科普团队参加互联网+还是创青春拿了一个不错的名次。

还拿到了Cambridge Conservation Initiative的保护奖Tony Whitten Conservation Award。

一共被公示了43个创新创业学分（关于课外活动或者科研一类的学分，教务系统最高只显示20个，培养方案说最多冲抵别的20个学分），大致也算是我们学校有创新创业学分以来数一数二的了，基本上别人在大三疯狂选的课我都用这部分的分给抵了。我大概就是一个很懒惰的人，不喜欢上课以及考试。分流时候专业，因为我的成绩，专业可以随便选，我选了课少的专业；然后对于限选，我选了分数冲抵的对待方式。

科普

一共参与了2次科普讲演，1次在上海，1次在济南。

创建了1个学院的社团——动物趣研社，担任了1年社长，在1年左右将科普的帐号经营到1万被关注。

一共参与过5次科普创作。1次绘本的科学指导，1次国外科普期刊的文章投稿，1次果壳一套书的部分审校，1次小学某读物约稿，1次院刊《生物通讯》的组稿。

休闲

一共看完了65部番剧；一共看完了48部电影（啥影评都没写）；一共听了369首歌曲（工作时必须戴着耳机才能进入状态，就算耳机没有音乐）；一共买了54本专业相关（不是教材的）书籍（吃土的源泉，其他书籍没有计入）。

关闭了FB，Ins，简书，微博（2.5万粉丝），Quora，Mastodon，朋友圈，QQ空间。目前的社交媒体大致有ResearchGate（如果算的话），GitHub（如果算的话），zhihu（吃瓜前线），sspai（只看RSS），twitter（从来不刷）就没了，即时通讯就Telegram外加WhatsApp还有俩腾讯系软件。GitHub提了2次PR，对于我这种计算机小白，已经尽力了。在RG上Follw了165个专业相关的灵魂，被52位Follow了，提出了5个问题，在各类问题下回复了18条评论（大概是和别人来回diss的比较多）。

个人

自己一直有抑郁症和焦虑症。目前一个减轻；一个加重。体重从130涨到了大二的140，现在又努力控制在了135往下。见识过了省精卫某些混子医生，被齐鲁医生的话语暖过，被千佛山开的所谓中药无语过。似乎还是北门的社区诊所靠谱点，经历了自己一个人去打针、做CT、抽血化验等等（甚至快凌晨）。

养了第一只猫猫，起名叫伊布，虽然我妈还是喜欢叫她咪咪，可以说跟我妈寸步不离。决定养她的时候心情十分低落，甚至想退学等一系列很沮丧的事情（觉得当时没有意义，包括整体的环境氛围让我沮丧），当时只是希望给自己一些坚持下去的羁绊，也算是比较自私的动机。但是因为伊布，自己简直快把一些小病小灾的处理方法实践了个遍（结合一些专业书籍），别了，三猫政策。

社交方面，大致还是没有什么突破。但是被学术上一个朋友捅过两次刀子，实在是不能把他当朋友；被微博大V组团（粉丝总量1296.2万）网暴过一次，不过发文章回怼回去了，同时还认识了一些志同道合的朋友并且见识到了社交媒体中心化的可怕后果，也见识了一些老师的冷眼旁观甚至嘲讽的所谓人情世故；和教务处和学院里部分老师产生了很大的矛盾（主要因为一些文件以及某些老师学术上的文盲行为，同时自己也能写出一份如何与学校打交道维护自己正当利益的指南了），到毕业都不想看见这些人。实验室成员对我都很体谅，关系都非常不错，是我理想中团队的样子；闺蜜不少；舍友对我也很包容；也有几个知心朋友，之前的朋友还算联系得比较多；实验室大部分老师还有我们院长对我真的很包容并且给予了很多帮助。

两种原因吧，我不喜欢一些人（似乎总看到别人的缺点，虽然我也不想），也不被一些人喜欢（虽然其中个别我至今都不知道什么原因）。可能是因为很多人不知道我为什么那么坚持一些观点、愿意做出头鸟，很多人不知道我在喜悦着什么、痛苦着什么，很多人更是没有共同的兴趣爱好可以交流。也有我表达的问题，我经常被说语言逻辑有问题、容易跳跃（容易越过好多步，突然想到那个脑补很多然后突然提出分手的女朋友笑话）。

现在交朋友，大致是随缘了，因为关闭了社交媒体，只有探讨很局限问题的人主动联系我才能够找到我，这样才有趣。对于亲密关系，大致是还没有准备好，可能需要更多的时间吧。

反思

专业

根本

从我的角度，生物专业应该是各类哲学影响下的数学知识的应用和数学规律的再总结。如果依照这样的课程设计，课程大概会让人云里雾里，但是或许这样才能从根本解析真正的生物学。我有点后悔的是没有好好了解各种哲学思想，这似乎有点偏科学史的意味，但是不一样的是科学史的主要是记录而并非让人系统地了解不同哲学思想是如何深刻影响着生物学科理论发展的。

比如最大简约法（Maximum Parsimony），生物信息课上要么不会提及，但这仍然是古生物系统发育中常用的方法；要么只会教授在MEGA7（非常老的版本，不明白不升级这个免费软件，他们怎么想的）中的使用。而从不会提及奥卡姆剃刀对其的影响，更不会提及应用奥卡姆剃刀的Willi Hennig。如果你单独去上科学史和进化论这门课，这门课也不会给你很好的指导，因为这种课一般都是选修，而老师可能会给你扯到文艺复兴（简直是上高中历史课，跟科学史没半点关系），因为他往往不是本院的老师（混行政的），肚子里没有真的东西，可能单纯为了完成教学任务（或者自己当老师的满足感），就算他提及了Henning，如果你不查阅相关书籍，你也不会联想到奥卡姆剃刀。其实也不是希望所有的东西都展现在你面前，那样并不能很好的让你思考，但是起码给个引导或许对今后会更好。

而至于数学方面，很惭愧，没有在大学初期深刻理解「万物即数」的深刻意义，最初也就没有很好地重视数学。个人学的生物统计并不是很好，课外也没有努力很多，但是如果通过R而不是SPSS，或许能让大家理解整个过程而不是哪个按键（这也是对我自己掌握专业软件的希望）。高数下学期的课程也没有认真复习和理解，或许当初应该下更多功夫。现在打算开始补，不过还是有点遗憾，希望能多上上数学（大学物理大致是不必了，目前讲的大致都是高中的内容），感觉又在立flag，希望能成功行动起来。

至于自己为什么那么相信「万物即数」，因为科学应该是可以量化的，如果不可量化，不可证伪，那大致就不是科学了；而且量化应该是可重复性的基础，因为别人不可能通过「一捧水、一勺盐」来重复你的实验和结论，如果不可重复，解释权归一个或者几个人所有，那大概就是神学了吧。

技术

我不得不承认自己在实际操作上掌握的软件更像是囫囵吞枣，只知道如何应用，不知道是什么样的原理，这让我在大三之后的很长一段时间都觉得自己是一个机器，而不是一个需要思考的人。但不得不承认这样现象在本科生和研究生中是普遍的，一个会使用MAFFT或者ClustalW的人不需要一丁点对于矩阵的了解就可以做到，甚至不需要命令行图形化界面即可，这或许推动了应用，但是这让只有少部分才能改进实验分析的方法或者选择方法。所以，我始终觉得掌握一门计算机语言很重要，但是自己太菜了，目前还没有办法用计算机实现「万物即数」的美好理想。

对于大部分语言，我学了一点然后被教程的时长搞放弃了，当时还不是在专业上考虑，而是想着自己要做一个完美的文献管理软件，构建出自己想象的样子是一件多么美好的事情，我也就对CS等学生十分佩服（对于我有种特殊的魅力）。现在开始重整旗鼓，觉得没有捷径可以走，老老实实学CS专业大一开始的内容，或许这样自己才能慢慢理解各种语言。

思考

慢慢地，我不再希望自己做低哲学含量的成果出来，如果一个成果没有一个很好的思索或者一种创新的方法但是有着有趣的结果或许还有意义；如果只是单纯的描述性的，似乎就缺失了意义。

Nelson (1970) 「https://doi.org/10.2307/2412278」将生物学分为了普通生物学（general biology）和比较生物学（comparative biology），粗略讲，比较生物学更加关注模式或者讲范式（patterns），普通生物学更关注特定的过程（processes）。当然，比较生物学的基础是普通生物学，所以我们不得不做或者尽量少做普通生物学，而尽可能整合不同哲学背景不同方法来进行的比较生物学工作。如果一味的扩大或者不扩大规模搞范式研究，工作意义不大，至少对于我来说，如果我那样做，可能人生的意义都会让我自己怀疑。

个人

极简主义

这里提到的极简主义是我自己改进的极简主义——信息极简主义（information minimalism）而不是 Dr Kal Newport 的数字极简主义（digital minimalism），至于差别，有很多（可以写出另外一篇文章），但是简单来说就是信息极简主义是关乎所有信息的而非仅仅是关乎数码设备的。

这件事情的起因是网暴让我认识到了中心化媒体的可怕之处，大多数人可能来龙去脉都不清楚，一味用一种标签化的信任来情绪化地支持或者反对某一个人，或许是因为一个中心化的平台容易产生盲目无序的崇拜，而这种平台对于我来说，输出了很低很低的信息量，更多输出的一种情绪。我本身就有抑郁症、焦虑症，我不希望浪费自己的情绪去参与与我毫不相干的事情，或者接受密度很低的信息。所以我关闭了大多数社交媒体。也因此，我慢慢戒掉来自己刷社交媒体的习惯，比如朋友圈、微博等等，但是还是不彻底，焦虑的时候容易不停刷email，不过也算是换了一种生活方式。

自然而然，我开始通过RSS阅读器接收自己选择的信息，并且不时去删除信息密度低或者相关度低的RSS源。这样还有一个好处，就是不让信息流占用你的时间和精力，主动做到信息节食。我突然就想到了我选修课（佛教文化课程）上，老师说的佛教讲求的「持戒即自由」，因为信息节食对于我来说就是「持戒」，而我的情绪则是达到了「自由」的状态，不再被外在不必要的信息裹挟，抑郁有了很好地缓解。老师讲的时候还不太明白，直到不想再与那些无用的信息争执，才终于开始明白，有种顿悟的奇妙感。

当有文章一类的信息我很感兴趣的时候，我不会立刻去读，而是传到自己的wallabag服务上，等到有时间整理，全面的去读，读完有用就做笔记，没有用就删除掉。但是自己还是有点懒惰，不够精进，对于很多话题，还是没有开始记笔记，wallabag上的条目越来越多。

其实这样做也是对资本的一种无声的反抗，我不希望自己的偏好等都无限地暴露于互联网，自然，我也不想自己也成为商品（而对方不需要你的同意并且对方不需要付出任何成本）。

开放

开放这里是指开放获取（Open Access）和开源（Open Source），这是我最近才开始慢慢倾向的事情，主要是因为商业公司永远都不能给予我安全感。

OA并不是仅限于出版商的OA，更是指Sci-Hub、LibGen等开创者的OA，让知识不再被出版商垄断。比如Wiley和Oxford数据库以及Routledge电子图书等数据库我的本科学校是完全没有的，但是他们掌握着大量的书籍和期刊。如果一个号称山东省（起码还算中上游）的双非中非常前列的学校都没有，那可想而知，多少本科生和研究生在获取资源中存在着困难（Routledge电子图书数据库国内外都很少买的）。所以我都有种信仰，RG上一定要上传全文并且将发表的论文挂在自己的网站上，方便获取。

OS则是对人信息的一种保障，比如，比较完美的闭源文献管理软件Citavi就在我购买后更改了云储存策略，甚至最近传出来开发团队人员大量变动的消息，如果一个OA的软件你就不会经历这些问题，不过，我很认同之前Citavi在云储存安全性方面对消费者说的话，大致是「永远都不要相信任何一家商业公司」，所以目前已经转移到了Zotero（但绝对不是最后一个文献管理软件）。再比如微软曾宣称Windows10是最后一个，结果呢，现在官网标明了2025年停止支持，所以我换到了ArchLinux（打包更多的AUR让更多像我这样的生物狗能更轻松地工作）。我所谓对OS的追求完全是因为商业公司很少遵守承诺。

开放，说实话，让我有了一种安全感，不用担心某一天电脑系统不能用、软件不能用、学术资源无处获取、自己的数据被售卖抑或销毁。

结语

对于我这么一个对孤独恐惧到爆炸的人来说，真的感谢周围人的包容、理解与帮助，也感谢自己的勇敢🏳️‍⚧️。

回想一路走来，大家都不容易，还好，现在我（快）毕业了（还没领取学位证）。

不过，这才刚开始，期待和更多有趣的人做更多有意思的事情。

附录：自己使用过的工具

信息

信息搜集

• RSSHub
• FreshRSS
• FluentReader / FeedReader
• Wallabag
• Geary ( Linux ) / Outlook ( Android )

信息归档

• Trilium
• EverNote（大一使用）
• OneNote （大三使用）
• Leanote （大四使用）
• Zotero
• Citavi

文字信息处理

• VS Code
• Microsoft Word / WPS Writer
• pandoc

媒体信息处理

• Adobe PhotoShop / GIMP
• Adobe Premiere Pro （只会很基础的功能）
• Adobe InDesign（大二使用）

信息分享

• Typecho（大三到大四使用）
• Mastodon（大四使用）
• Hugo

专业

系统发育软件

• SeqMan
• MAFFT
• GBlocks
• DAMBE
• jModelTest
• DAMBE
• SeqenceMatrix
• RAxML-NG
• MrBayes
• PAUP*
• IQ-TREE
• MEGA
• FigTree
• BEAST2 /  BEAST
• NONA（不熟练）
• TNT（不熟练）
• WinClada（不熟练）

形态软件

• DELTA
• tpsDig
• tpsUtil
• tpsRelw
• MorphoJ

群落软件

• DnaSP
• Arlequin

生物统计

• RStudio / R （只会用一些包和非常基础的）

系统软件

• Windows 10（大一到大三使用）
• CentOS 7（VPS，大三使用）
• Ubuntu Mate 20.04（VMWare，大三使用）
• Ubuntu 18.04 （VPS，大四使用）
• Ubuntu 20.04（大四使用）
• Manjaro KDE（大四使用）
• Kubuntu（大四使用）
• Manjaro Gnome（大四使用）
• ArchLinux